As disfunções visíveis (água, sedimentos, flora) são apenas os sintomas de uma saturação química do meio. Os indicadores de alerta são os seguintes:
- Turbidez persistente: A água apresenta uma opacidade crônica, verde (fitoplâncton) ou marrom (matéria húmica), que resiste à renovação hidráulica.
- Proliferação vegetal oportunista: Desenvolvimento massivo e rápido de algas filamentosas ou de macrófitas invasoras (Jussie, Myriophyllum) favorecido por um meio rico.
- Atividade bentônica anaeróbia: Liberação de bolhas na superfície (metano) e odores sulfurosos (H₂S) durante a agitação da água, indicando uma fermentação ativa dos fundos.
- Sedimentação rápida: Acúmulo de lodo negro, fluido e não mineralizado, reduzindo a batimetria útil.
- Instabilidade do oxigénio dissolvido: Os peixes apresentam sinais de hipóxia (borbulhar à superfície) ao amanhecer, consequência do consumo noturno de oxigénio pela biomassa.
